SCG1000單細胞高效液滴生成儀
譜今生物與森西賽智聯(lián)合研發(fā)的SCG1000單細胞液滴生成儀能為細胞或細胞核的高效分離和標記提供穩(wěn)定的動力。
該儀器配備8個獨立控制的微流控芯片,支持1-8個樣本靈活上樣;
2.5 min 內(nèi)快速生成油包水液滴,最大限度保障細胞活性;
單張芯片可捕獲18,000個細胞,細胞捕獲率高達60%;
兼容單細胞3’、5’、ATAC文庫制備需求。
詳情
產(chǎn)品介紹
譜今生物與森西賽智聯(lián)合研發(fā)的SCG1000單細胞液滴生成儀能為細胞或細胞核的高效分離和標記提供穩(wěn)定的動力。
SCG1000單細胞數(shù)字液滴系統(tǒng) (Digital Droplet System)可以自動化、一鍵式完成單細胞分離、捕獲及標記,搭配譜今生物自主研發(fā)的高通量單細胞試劑盒進行使用,同時配備單細胞數(shù)據(jù)分析軟件SCG Tools 進行數(shù)據(jù)分析。
產(chǎn)品原理
SCG1000單細胞單細胞液滴生成儀是基于微流控技術(shù),將帶有條形碼和引物的編碼微球和單個細胞包裹為獨立的微反應(yīng)體系。編碼微球尾部設(shè)計了Cell Barcode(標記細胞)、UMI(標記mRNA)和OligodT(與mRNA的polyA特異性互補配對),完成細胞及mRNA的分離標記,通過逆轉(zhuǎn)錄及高通量測序文庫的測序,獲取mRNA的3端序列,即可一次性獲得大量單細胞的基因表達數(shù)據(jù),從而實現(xiàn)在單細胞水平進行轉(zhuǎn)錄組測序的目的。其能夠以高通量和單分子分辨率研究單個細胞表達譜,揭示復(fù)雜細胞群體的異質(zhì)性,避免單個細胞的基因表達信號被群體的平均化所掩蓋,在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用正成為生命科學(xué)研究的焦點。
實驗流程
① 單細胞分離標記
將制備好的單細胞懸液通過SCG1000液滴生成儀的“¥”字形通道形成為微反應(yīng)體系。
② 單細胞文庫構(gòu)建
在液滴內(nèi)進行反轉(zhuǎn)錄;然后通過cDNA擴增、連接測序接頭等進行高通量測序文庫的制備。
③ 高通量測序
在高通量測序平臺進行測序,可兼容Illumina和華大測序平臺。
④單細胞數(shù)據(jù)分析
通過單細胞數(shù)據(jù)分析軟件SCG Tools自動完成細胞標簽的提取、數(shù)據(jù)質(zhì)控、基因定量以及聚類分析等,并生成可視化的分析報告。
產(chǎn)品特點
樣本通量:8個單獨控制的微流控芯片,單次運行1-8個樣本;
細胞通量:單次可獲得500-18,000個細胞;
單細胞捕獲效率:2.5min中內(nèi)生成15-20萬微液滴,細胞捕獲率60%;
雙細胞率:1000個細胞,雙效率約0.3%;
細胞范圍:可捕獲細胞直徑為5~50 μm的真核細胞(貼壁細胞、懸浮細胞、組織、血液等);
配備軟件分析系統(tǒng):配備的單細胞數(shù)據(jù)分析軟件SCG Tools自動完成細胞標簽的提取、數(shù)據(jù)質(zhì)控、基因定量以及聚類分析等,并生成可視化的分析報告;
適用文庫類型:兼容單細胞3’、5’、ATAC文庫制備需求。
儀器搬運方便:體積小,重量輕( 3.6 kg),方便搬運,便于隨時隨地進行單細胞實驗。
產(chǎn)品優(yōu)勢
應(yīng)用展示
一、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域
腫瘤研究:
①腫瘤異質(zhì)性分析:精確識別腫瘤組織中不同類型的癌細胞及其亞群,研究腫瘤的發(fā)生、發(fā)展機制以及對治療的反應(yīng)差異機制(包括耐藥機制等)。
②腫瘤微環(huán)境研究:分析腫瘤微環(huán)境中的免疫細胞、基質(zhì)細胞等其他非癌細胞的組成和功能狀態(tài),研究免疫細胞與癌細胞的相互作用。
③治療監(jiān)測和預(yù)后判斷:通過追蹤治療過程中腫瘤細胞的基因表達變化,監(jiān)測治療效果,預(yù)測患者的預(yù)后情況,及時調(diào)整治療策略。
免疫系統(tǒng)疾病研究:分析免疫細胞的異質(zhì)性,研究免疫系統(tǒng)疾病的發(fā)病機制,為疾病的診斷和治療提供新的靶點和思路。
感染性疾病研究:研究感染機制,分析感染過程中宿主細胞和病原體的相互作用,了解病原體的感染途徑、宿主細胞的免疫反應(yīng)等。
生殖健康
①胚胎植入前遺傳學(xué)診斷:在輔助生殖技術(shù)中,對胚胎的單個細胞進行測序,檢測染色體異常、基因突變等遺傳缺陷,選擇健康的胚胎進行移植,提高試管嬰兒的成功率,降低出生缺陷的風(fēng)險。
②生殖細胞發(fā)育研究:研究精子、卵子等生殖細胞的形成過程和發(fā)育機制。
二、生物學(xué)基礎(chǔ)研究領(lǐng)域
發(fā)育生物學(xué):研究胚胎發(fā)育過程中不同細胞的分化、增殖和遷移等過程,揭示細胞命運決定的分子機制。
神經(jīng)科學(xué):分析神經(jīng)系統(tǒng)中不同類型神經(jīng)元細胞的基因表達和功能差異,研究神經(jīng)元的發(fā)育、連接和信號傳遞機制,對于理解大腦的結(jié)構(gòu)和功能以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)病機制具有重要意義。
三、藥物研發(fā)領(lǐng)域
藥物靶點發(fā)現(xiàn):通過對疾病相關(guān)細胞的單細胞分析,發(fā)現(xiàn)新的藥物靶點,為藥物研發(fā)提供新的方向。
藥物篩選和評估:利用單細胞技術(shù)評估藥物對不同細胞的作用效果,篩選出具有治療潛力的藥物。可以分析藥物處理后細胞的基因表達、代謝變化等,預(yù)測藥物的療效和毒性。